離子色譜柱是離子色譜系統的核心部件，主要用于分離和分析水溶液中的陰陽離子，其分離基于離子交換機制，使用表面帶有離子交換基團的離子交換劑作為固定相。帶負電荷的交換基團（如磺酸基和羧酸基）用于陽離子的分離；帶正電荷的交換基團（如季胺鹽）用于陰離子的分離。當樣品溶液通過色譜柱時，不同離子與交換基團的作用力大小不同，因此在樹脂中的保留時間長短也不同，從而實現離子的相互分離。
離子色譜柱的特點：
快速、方便：完成分析任務所需時間短，對7種常見陰離子（F?、Cl?、Br?、NO??、NO??、SO?²?、PO?³?）和六種常見陽離子（Li?、Na?、NH??、K?、Mg²?、Ca²?）的平均分析時間分別小于10分鐘，用高效快速分離柱對上述七種陰離子的分離只需3分鐘。
靈敏度高：離子色譜分析的濃度范圍為μg/L-mg/L。直接進樣50μl，對常見陰離子的檢出限小于10μg/L。對電廠、核電廠以及半導體工業所用高純水，通過增加進樣量、采用小孔徑柱（2mm直徑）或在線濃縮等方法，檢出限可達10?¹²g/L或更低。
選擇性好：IC法分析無機和有機陰陽離子的選擇性主要由選擇適當的分離和檢測系統來達到。與HPLC相比，IC中固定相對選擇性的影響較大。用電導檢測器時，抑制技術很重要；選用溶質特性檢測器以改善某些復雜樣品分析的選擇性；柱后衍生方法的發展提高了對金屬離子、多價陰離子和硫酸鹽等的檢測選擇性。
可同時分析多種離子化合物：只需很短的時間就可得到陰、陽離子以及樣品組成的全部信息，但這種同時檢測的能力受樣品中不同成分之間的巨大濃度差的限制。
分離柱的穩定性好、容量高：分離柱的穩定性取決于柱填料的類型，離子色譜法中用得廣的填料是苯乙烯/二乙烯基苯聚合物，這種樹脂的高pH穩定性允許用強酸或強堿做淋洗液，有利于擴大應用范圍。
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